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桃果实中miR393b靶向生长素受体基因TIR1的作用机制分析
桃 miR393b TIR1
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2018/11/26
本研究以水蜜桃品种‘小白凤’为试材, 利用miR-RACE技术验证了桃miR393b的精确序列, 克隆得到了其靶基因生长素受体PpTIR1的ORF序列。利用RLM-RACE技术以及qRT-PCR方法对Ppe-miR393b作用于靶基因PpTIR1的作用模式及作用频度进行了分析。结果表明, Ppe-miR393b的精确序列与预测序列在5′端存在1个碱基的差异, 其靶基因PpTIR1编码584个氨基酸...
拟南芥TIR1与生长素IAA相互作用的分子对接及分子动力学研究
拟南芥TIR1 吲哚乙酸(IAA) 辅酶InsP6 分子对接 分子动力学模拟
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2009/11/25
基于最新得到的拟南芥运输抑制剂响应蛋白质1(TIR1)与吲哚乙酸(IAA)复合物的晶体结构, 使用分子对接方法和分子动力学方法对TIR1与生长素IAA相互作用的方式进行了研究. 分子对接结果表明, 通过逐级考察辅酶InsP6和中心水分子的影响, 发现辅酶InsP6和中心水分子对生长素IAA正确结合到活性位点有重要作用. 分子动力学结果表明, 复合物体系在整个模拟过程中较为稳定, 2个水分子相继作为...
Cloning and Bioinformatics Analysis of TIR1 cDNA from Super Hybrid Rice Parental Line 1S
生长素受体 生物信息学 超级杂交水稻 TIR1
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2009/11/18
生长素受体TIR1通过形成SCFTIR1复合体与生长素直接结合, 即为Aux/IAA在26S 蛋白酶体降解过程中的关键蛋白质。在Blas t检索和生物信息学分析的基础上设计特异引物, 以超级杂交水稻(Oryz a sativa)亲本株1S为材料, 通过RT-PCR扩增并经T-A克隆后测序, 获得一条长度为2 219 bp 的序列, 其开放阅读框长度为1 764 bp, 编码含587个氨基酸残基的肽...
生长素受体TIR1与四种生长素分子间相互作用的分子对接研究
分子对接 生长素 F-盒式蛋白质TIR1 氢键作用 疏水相互作用
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2010/4/19
依据生长素分子的分类以及生长素活性的不同, 选取四种生长素分子IAA, 1-NAA, 2,4-D, 2-NAA分别与生长素受体分子进行分子对接计算研究. 对生长素受体分子进行逐级对接计算. 首先, 通过分子对接计算研究辅酶InsP6以及中心水分子在生长素反应中的重要作用; 其次, 比较受体大分子完全刚性以及活性残基部分柔性的两种情况下的分子对接结果, 说明AutoDock4实现了受体分子活性残基的...