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中国科学院青岛生物能源与过程研究所提出微生物组功能的校正算法Meta-Apo（图）
微生物组 功能 校正算法 Meta-Apo
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2021/1/25
基于元基因组测序的微生物组功能分析和比较在疾病诊断、生态监控、生物安全等领域具有广阔应用价值，但是高昂的成本限制了其更广泛应用。日前，青岛能源所单细胞中心开发了微生物组功能校正算法Meta-Apo（Metagenomic Apochromat），为大规模的菌群功能比较提供了一种保证分析精度的同时可大幅降低实验和计算成本的解决方案。目前，微生物组功能的分析和比较，主要基于基因组序列进行代谢重建。路线...
病毒感染因子Vif对控制HIV-1病毒的感染能力非常重要, 它通过和细胞抗病毒蛋白APOBEC家族(简写成APO)的相互作用, 引发APO的快速降解从而阻止APO被包装到新生的病毒粒子中. 在本论文中, 我们提出一个数学模型来定量地描述这种典型的病毒-宿主相互作用. 为检验该模型, 我们将计算模拟结果和4组已发表的实验数据进行了对比. 在此基础上进行了系统的参数敏感性分析和扰动分析, 表明与APO...
由于PCR影响因素多，获得理想扩增结果比较困难，有必要寻找一种简单有效的方法建立最佳扩增体系.针对Mg2+浓度、二甲基亚砜(DMSO)浓度、变性时间、延伸时间、循环次数等因素进行4因素6水平和6因素10水平均匀设计实验优化apo E基因244 bp片段的PCR扩增条件.采用纯化模板和简易模板，只需6～10次实验即可获得特异性、高产率扩增结果.研究表明，将均匀设计用于PCR条件优化以及有关的样品处理...
重组apo(a) Kringle Ⅳ-10对纤溶酶原与内皮细胞结合的影响
内皮细胞 纤溶酶原 apo(a)KringleⅣ-10 赖氨酸结合
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2008/1/5
摘要 通过研究重组apo(a)KringleⅣ 10 (KⅣ 10 )的赖氨酸结合能力对纤溶酶原与内皮细胞结合的影响 ,探讨apo(a)在抑制纤溶过程中的作用 ,为脂蛋白 (a) [lipoprotein(a) ,Lp(a) ]致动脉粥样硬化机理研究提供依据 .将含apo(a)野生型KⅣ 10 ((wild typeKⅣ 10 Trp72 ,wt KⅣ 10 Trp72 )和突变型K...