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4龄中华鲟垂体的EST分析
cDNA 表达序列标签 中华鲟 垂体
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2009/8/26
表达序列标签 (Expressed sequence tag, EST) 是鉴定基因表达规律和发现新基因的一种有效的分子生物学手段。为了能在中华鲟(Acipenser sinensis Gray) 中发现与生长和生殖内分泌调控相关的基因，我们构建了中华鲟垂体的SMART cDNA质粒文库。垂体是调节生长和生殖内分泌的重要器官。在本研究中，通过测序筛选得到了944个EST克隆，将所得EST 与 Ge...
肉色伪角毛虫(纤毛门，腹毛目)的cDNA文库构建及部分EST序列分析
海洋纤毛虫 肉色伪角毛虫 cDNA文库 EST序列 功能注释
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2009/8/26
以海洋腹毛类纤毛虫-肉色伪角毛虫为材料开展了cDNA文库的构建和部分基因表达序列标签（EST）的分析。其中，利用Smart技术构建cDNA文库，质量检测表明该文库容量为1×106 pfu/mL，重组率为91%，表明所建文库能够满足后续的EST文库构建及从文库中分离筛选重要基因等研究工作。从该库中随机抽取了237个克隆进行5′端测序，拼接后得到189条非冗余基因（UniGene），Blast X比对...
摘要：数量迅速增加的EST (expressed sequence tags) 为分子标记的开发提供了宝贵的资源。与来自于基因组DNA开发的传统标记相比, 以EST为基础的分子标记是一种新型分子标记, 具有其显著的优势, 如开发简便、信息量高和通用性好等, 在多方面都有重要的利用价值。本文详细地介绍了目前基于EST开发的5类分子标记以及基于生物信息学方法的开发策略, 这些标记包括EST-PCR、E...
利用EST及生物信息学方法挖掘马铃薯中miRNA及其靶基因
miRNA 生物信息学预测 靶基因 马铃薯
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2013/10/9
microRNA (miRNA)是一类调控真核基因转录后表达的非编码小分子RNA. 大量研究表明, miRNA在调节生物功能方面起着重要的作用. 目前发现miRNA的主要方法有直接克隆法和基于生物信息学的基因搜索和同源搜索. 由于真核生物组织中有些miRNA的丰度较低, 而且其表达具有组织和时序特异性, 采用直接克隆法发现新的miRNA有时较为困难. 采用生物信息学方法寻找未知miRNA是当前发现...