搜索结果: 1-15 共查到“农学 16S rRNA”相关记录18条 . 查询时间(0.069 秒)
基于线粒体16S rRNA全序列分析我国绵羊痒螨兔亚种的遗传多样性
绵羊痒螨兔亚种 16S rRNA基因 遗传多样性
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2018/5/29
为了探讨我国绵羊痒螨兔亚种的遗传变异特征和种群结构，利用PCR技术对我国5个地理区域（华北、华东、华中、西南、西北）的83个绵羊痒螨兔亚种株的线粒体16S rRNA全序列进行扩增和遗传多样性分析。结果显示，83个样品的16S rRNA全序列长度均为1 025 bp，共存在83个变异位点和52个单倍型；样品所代表的5个地理区域种群间的Fst值为-0.037 59~0.587 63，基因流值为-6.9...
16S rRNA高通量测序方法检测羊圈空气微生物群落结构及多样性
羊圈空气 微生物群落及多样性 MiSeq测序
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2017/8/3
以羊圈空气微生物为研究对象，了解羊圈空气中细菌群落结构以及致病菌属特征。将来自10个不同羊场的羊圈空气样本，应用Illumina MiSeq高通量测序技术测定羊圈空气中细菌的16S rRNAV3-V4变异区序列，分析不同空气样本细菌群落组成。结果显示：空气样本中的细菌在97%的相似水平下共得到OTU个数为33 408，涵盖了25门、66纲、123目、253科、547属、444种的细菌。通过微生物多...
Comparison of Fecal Microbiota of Mongolian and Thoroughbred Horses by High-throughput Sequencing of the V4 Region of the 16S rRNA Gene
Fecal Microbiota 16S rRNA Gene High-throughput Sequencing Mongolian Horses
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2016/11/10
The hindgut of horses is an anaerobic fermentative chamber for a complex and dynamic microbial population, which plays a critical role in health and energy requirements. Research on the gut microbiota...
对光滑河蓝蛤Potamocorbula laevis，黑龙江河蓝蛤Potamocorbula amurensis，焦河蓝蛤Potamocorbula ustulata，红肉河蓝蛤Potamocorbularub romuscula 4个野生种共40个个体的线粒体COI 和16S rRNA基因片段进行了扩增和测序，经过筛选和剪切，得到长度为650 bp和450 bp的片段。序列分析显示，序列的碱基组...
豫陕两省14株鸡杆菌的gyrB、16S rRNA和rpoB基因序列比较分析
鸡杆菌 鸭源鸡杆菌 16S rRNA rpoB gyrB 进化分析
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2013/12/2
分析河南、陕西分离的14株鸡杆菌（Gallibacterium）之间的进化关系，及gyrB基因序列比较在该菌进化分析中的作用。PCR扩增鸡杆菌分离株的gyrB、16S rRNA和rpoB 3个看家基因，PCR产物纯化后直接测序。将鸡杆菌分离株、国外参考株的3个看家基因序列进行比较分析，用Phylip 3.67软件构建进化树。结果表明，14株鸡杆菌与鸭源鸡杆菌 （Gallibacterium ana...
病犬大肠杆菌16S rRNA甲基化酶基因检测研究
病犬大肠杆菌 16S rRNA 甲基化酶 基因检测研究
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2011/8/31
为了解郑州市发病犬大肠杆菌对氨基糖苷类药物高度耐药的16S rRNA甲基化酶流行情况，本研究测定了分离自河南郑州市宠物医院发病犬的123株大肠杆菌对氨基糖苷类代表药物阿米卡星的敏感性；分别设计6种16S rRNA甲基化酶基因特异性引物，对耐药分离株进行16S rRNA甲基化酶基因PCR扩增检测。检测结果显示，在发病犬大肠杆菌中仅检测到armA和rmtB，其检出率分别为3.25%（4/123）和38...
牛无浆体16S rRNA基因的克隆测序及分析
牛无浆体 16S rRNA PCR 序列分析
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2013/12/5
从自然感染无浆体的重庆黄牛无菌采集血液，提取全血基因组，用血营养菌16S rRNA基因的通用引物进行PCR扩增，得到长约1 500 bp的扩增片段，将其克隆到pMD18-T载体后进行测序，并与5条边缘无浆体、4条中央无浆体、4条牛无浆体、4条羊无浆体和3条嗜吞噬细胞无浆体16S rRNA基因序列进行系统发育分析。结果表明所克隆的基因片段长度为1 412 bp，GenBank登录号为FJ169957...
利用16S rRNA和COI基因序列对三疣梭子蟹不同群体遗传特征的比较分析
16S rRNA COI基因序列 三疣梭子蟹 群体遗传
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2015/5/29
采用PCR扩增技术对三疣梭子蟹日本北海道群体、韩国东海岸群体和我国山东即墨市会场村群体3个野生群体的16S rRNA和COI基因片段进行了扩增和测序，分别得到了长度为523和658bp的片段。通过统计变异位点、平均核苷酸差异数和核苷酸多样性指数，分析比较了不同群体间的序列差异和遗传多样性水平。结果显示，我国会场三疣梭子蟹野生群体的遗传多样性水平较低。用MEGA 4.0软件中的NJ法构建的分子进化树...
云南省东方蜜蜂线粒体16S rRNA基因的扩增及序列分析
云南省东方蜜蜂 线粒体 16S rRNA基因
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2009/6/10
扩增、测定和分析了云南省东方蜜蜂16个地理居群线粒体16S rRNA基因部分序列，并结合从GenBank获得的蜜蜂科3个其它种的16S rRNA序列，以离颚细蜂科的Vanhornia eucnemidarum为外群，利用邻接法、最大简约法和最大似然法重构了它们的种系发生关系。结果显示，云南省东方蜜蜂16S RNA基因部分序列很保守，不同地理居群均得到435bp完全一致的基因序列；通过对蜜蜂科...
【研究目的】旨在研究两种常用的细菌分型方法对感染猪的肠球菌鉴定结果进行比较。【方法】对从河南洛阳、济源、许昌、南阳等地送检病猪体内分离到42株革兰阳性球菌分离纯化后，分别用16S rRNA基因序列和Vitek-32全自动细菌鉴定系统对其进行鉴定。【结果】Vitek-32对42株分离菌中的34株鉴定到种的水平，分别是粪肠球菌(E. faecalis) 10株、屎肠球菌(E. faecium) 2株、...
大额牛瘤胃细菌16S rRNA基因序列分析
大额牛 瘤胃细菌 16S rRNA基因序列 系统进化分析
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2009/3/2
【目的】研究大额牛(Bos frontalis）瘤胃细菌16S rRNA基因序列，为揭示大额牛瘤胃细菌组成的多样性以及开发这一珍稀生物资源提供分子生物学依据。【方法】采用细菌通用引物F27和R1492对目标基因进行PCR扩增，克隆、测序后利用Neighbor-joining方法构建系统进化树。【结果】共获得147个16S rRNA基因序列，在GenBank登录号为DQ673466～DQ673612...
外来种互花米草盐沼土壤微生物16S rRNA特征分析——以江苏省潮间带为例
土壤微生物多样性 16S rRNA DGGE 外来种 互花米草盐沼
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2008/5/28
通过对互花米草盐沼和对应光滩的土壤微生物16S rRNA的特征检测,分析了外来种互花米草的侵入对潮间带生态系统土壤微生物多样性的影响。试验中采集了江苏滨海不同季节光滩与互花米草(Spartina alterniflora)盐沼的土壤,直接提取法分离得到其中的土壤微生物DNA,并采用Sepharose 4B吸附柱对DNA进行纯化,有效地去除了腐殖酸,得到纯度较高的DNA样品模板。通过选取特异引物扩增...
猪附红细胞体16S rRNA基因的序列测定和系统进化分析
猪附红细胞体 16S rRNA基因 系统进化分析
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2008/4/10
从确诊为猪附红细胞体感染的猪场，无菌采集血样，抽提猪附红细胞体基因组DNA，采用真细菌的通用引物进行16S rRNA基因扩增，对扩增产物进行克隆和测序。从3个地理位置不同的猪场均成功地扩增出长度为1 469 bp的核苷酸序列。系统进化分析表明，3个猪场样品所测序列一致性达99.52%以上，具有相同的基因型，但与国外报道的猪附红细胞体Illinois株同源性为95%，属于同一基因群，但基因型不同；所...
温氏附红细胞体16S rRNA基因的序列测定和分析
温氏附红细胞体 16S rRNA PCR 序列分析
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2008/4/9
从自然感染附红细胞体的湖北黄牛无菌采集血液，分离附红细胞体并提取病原基因组，用血营养菌的16S rRNA 基因的通用引物进行PCR扩增，得到长约1.5 kb的扩增片段，将其克隆到pMD18-T载体后进行测序和分析。结果表明该片段全长为1 471 bp（GenBank收录号为AY946266），同源性分析表明该序列与Neimark公布的温氏附红细胞体(AF016546)的16S rRNA 基因序列同...
日本沼虾3群体线粒体16S rRNA基因片段序列的差异与系统进化
日本沼虾 16S rRNA基因 系统进化 沼虾属
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2008/3/19
通过对日本沼虾（Macrobrachium nipponense）3个群体线粒体DNA 16S rRNA基因片段进行扩增和测定，得到长度为495 bp的片段，其碱基A、T、G和C的平均含量分别为 28.6%、36.1 %、22.7%和12.5%，AT含量明显高于GC含量。通过对日本沼虾16S rRNA基因片段遗传特征的研究发现其种内变异很小，在3个群体中只有5个位点发生转换。另外，利用其454 b...