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山东省林业科学研究院专利:一种AFLP引物及其在构建旱柳分子指纹图谱中的应用
山东省林科院 AFLP引物 旱柳分子 指纹图谱
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2024/6/12
利用AFLP分子标记技术,在DNA水平分析矮凤梨(Ananas nanus)品种‘Hime Pineapple’与其短营养期突变体‘14-1’之间的差异,鉴定突变体变异的真实性,为短营养期菠萝的分子育种提供参考依据。以‘14-1’和‘Hime Pineapple’的幼叶为试材,采用改良CTAB法提取叶片基因组DNA,经64对AFLP引物组合的选择性扩增,共获得1 952条清晰谱带,平均每对引物产生...
【目的】为了明确南繁区稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)的遗传分化情况,【方法】采用AFLP分子标记技术对南繁核心区(三亚、乐东和保亭)和非核心区(琼中、屯昌和定安)共60个稻瘟病菌菌株的遗传多样性和群体遗传结构进行了比较分析。【结果】聚类分析表明,几乎所有菌株都聚在同一个谱系里,并且该谱系没有明显的亚群;群体遗传结构分析表明,核心区群体的多态性位点百分率、Shannon信息指数和基...
Breed Discrimination Using DNA Markers Derived from AFLP in Japanese Beef Cattle
AFLP Breed Discrimination Beef Cattle Japanese Black Holstein
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2016/4/21
In the meat industry, correct breed information in food labeling is required to assure meat quality. Genetic markers provide corroborating evidence to identify breed. This paper describes the developm...
我国大麦条纹病菌(Pyrenophora graminea)群体遗传多样性AFLP分析
大麦 条纹病 麦类核腔菌 AFLP标记 聚类分析
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2017/11/23
条纹病是重要的种传真菌病害之一, 能对大麦生产造成严重产量损失。本研究利用AFLP方法对来自青海、河南等10省份大麦种植区的条纹病菌菌株进行遗传多样性分析, 从分子水平上揭示我国不同大麦产区的条纹病菌群体遗传差异。结果显示, 利用8对AFLP选择性引物组合对19份大麦条纹病菌进行了全基因组多态性扩增, 共获得144条可统计的条带, 其中112条具有多态性, 多态性条带占77.8%。在相似系数为0....
Identification of predicted genes expressed differentially in pituitary gland tissue of young growing bulls revealed by cDNA-AFLP technique
Bos taurus breeds differential display gene expression Hereford Limousine polyacrylamide gel electrophoresis restriction enzymes developmental ages real time PCR
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2015/6/24
Differentially expressed transcript derived fragments (TDFs) of bovine pituitary gland tissue at different developmental ages of Limousine and Hereford bulls were identified by cDNA-AFLP technique. St...
Diversity of Oat Crown Rust (Puccinia coronata f.sp. avenae) Isolates Detected by Virulence and AFLP Analyses
Puccinia coronata f.sp. avenae oat crown rust
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2015/3/5
Forty Puccinia coronata f.sp. avenae isolates from several European countries and Israel were tested for virulence
to 18 differential oat lines. Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) analysi...
基于遗传连锁图谱筛选虾夷扇贝性别相关AFLP分子标记的方法
虾夷扇贝 性别相关标记
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2015/5/26
基于近年来他人构建的遗传连锁图谱,对 2011–2013 年2–5 月期间采集的雌性、雄性及雌
雄同体虾夷扇贝进行性别相关 AFLP 分子标记筛选。从雄性和雌性遗传连锁图谱上选取合计 18 对
引物组合,经 3 批次试验,有 8 对引物扩增出性别相关的条带,其中 EbMc、EjMf和 EiMk 重复性
好,有 4 对引物扩增出雌雄同体特异性条带,5对引物扩增出雌性特异性条带。结果表明,基于高...
棉纤维次生壁加厚期cDNA-AFLP表达谱剖析和转录组图谱构建
棉花 cDNA-AFLP 表达片段(TDFs) 转录组图谱 纤维发育,
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2013/10/8
棉纤维强度主要由棉纤维次生壁加厚期决定. 以陆地棉品种中棉所8号和海岛棉品种Pima90-53建立的包含109个单株的种间杂交F2群体为材料, 用cDNA-AFLP对棉纤维发育次生壁加厚期(20~25 DPA)基因表达谱进行剖析, 并构建了次生壁加厚期转录组图谱. 37对AFLP引物组合共检测到138个多态性表达片段(transcript-derived fragments, TDFs), 大小在...
38株维氏气单胞菌分离株的AFLP基因分型研究
维氏气单胞菌 DNA扩增片段长度多态性 基因分型 指纹图谱 聚类分析
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2013/10/16
试验通过人工设计合成的通用接头以及与接头序列相匹配的专用引物,对38株维氏气单胞菌分离株和1株维氏气单胞菌标准菌株进行AFLP基因分型研究。结果显示,采用5对引物使39株维氏气单胞菌扩增出1080条可见条带,片段长度在50-1000 bp之间, 其中多态性条带727条, 平均每对引物组合产生154条多态性条带, 平均多态性检出率为66.7%。按UPGMA方法对条带进行聚类分析,建立聚类分支树状图,...
菠菜种质遗传多样性和亲缘关系的AFLP 分析
菠菜 遗传多样性 亲缘关系 AFLP
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2013/9/8
利用AFLP 标记技术对110 份来源不同的菠菜(Spinacia oleracea L.)种质进行遗传多样性分析,结果表明,筛选出的20 对EcoRⅠ/MseⅠ引物组合共扩增出882 条带,其中208 条多态性条带,多态性比率23.6%;种质间的遗传相似系数为0.64 ~ 0.87,不同来源组群的Nei’s 遗传多样性指数范围为0.1887 ~ 0.2501,总体为0.2830,Shannon ...
对中国红肉猕猴桃种质资源进行收集和调查,并对其进行果实性状变异分析和AFLP 遗传多样性及遗传关系分析。结果表明,红肉猕猴桃野生资源主要分布于湖南省、湖北省、河南省、江西省、四川省和陕西省等地,共采集到52 份野生资源和2 份品种资源(包括软枣猕猴桃红肉类型、中华猕猴桃红肉类型和美味猕猴桃红肉类型)。红肉猕猴桃种质资源在果实性状和DNA 分子水平上都存在丰富的变异和较高的遗传多样性水平,4 对AF...
AFLP标记与棉花重要农艺性状的关联研究
棉花 AFLP 关联 农艺性状
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2014/4/1
以陆地棉(Gossypium hirsutum L.)品种中棉所8号和海岛棉(Gossypium barbadense L.)品种Pima 90-53杂交产生的包含91个单株的BC1F2群体及其衍生BC1F2:3群体为材料,利用逐步多元回归分析确定分子标记与重要农艺性状的相关关系,为分子标记辅助选择提供依据。试验材料分别种植在保定市郊和沧州青县两个点,每个株行考察衣分、子指、铃重、皮棉重、子棉重5...
AFLP标记与棉花重要农艺性状的关联研究
棉花 AFLP 关联 农艺性状
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2013/8/2
以陆地棉(Gossypium hirsutum L.)品种中棉所8号和海岛棉(Gossypium barbadense L.)品种Pima 90-53杂交产生的包含91个单株的BC1F2群体及其衍生BC1F2:3群体为材料,利用逐步多元回归分析确定分子标记与重要农艺性状的相关关系,为分子标记辅助选择提供依据。试验材料分别种植在保定市郊和沧州青县两个点,每个株行考察衣分、子指、铃重、皮棉重、子棉重5...
盐胁迫下棉属野生种旱地棉(Gossypium aridum)差异表达基因的cDNA-AFLP分析
棉属 盐胁迫 cDNA-AFLP 转录片段 实时定量PCR
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2013/8/2
以一个耐盐的二倍体野生种旱地棉和对盐敏感的陆地棉栽培种苏棉12号为材料,运用cDNA-AFLP技术,比较两个材料分别在盐胁迫前后的表达情况,获得了25个仅在旱地棉盐胁迫下特异表达的转录片段(TDF)。将这些片段进行电子克隆,延伸后的序列进行BLAST分析,结果显示23个转录片段推断的氨基酸序列与已知的蛋白同源,这些盐诱导表达的基因主要涉及离子转运、活性氧清除、细胞信号传导、细胞分裂、转录调节、膜保...