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MMP-2和Hydroxamate类抑制剂绝对自由能的计算     抑制剂  分子动力学  线性响应理论  自由能  锌离子  药物  结合能  分子设计         font style='font-size:12px;'> 2007/12/19
摘要 采用基于线性响应近似的自由能计算方法计算了一类hydroxamate抑制剂和MMP-2的绝对结合自由能。计算中,催化锌离子和MMP-2以及配体之间采用了非键模型。分子动力学模拟结果显示,采用非键模型时,催化Zn离子采用五配位的形式,但配位键的形式和初始结构比较有很大的差别。通过拟合,分别得到了单参数、双参数以及三参数的自由能预测模型,其中,含有常数校正项的三参数模型具有最佳的预测能力,预测自...
摘要为获得综合性能更好的锂离子二次电池正极材料, 分析了Co掺杂对LixNiO2电化学性能的影响. 采用密度泛函DFT理论对LixNiO2和LixNi0.5Co0.5O2的平均放电电压和态密度进行了计算. 同时, 用共沉淀法制备了LixNiO2和LixNi0.5Co0.5O2锂离子二次电池正极材料, 并对其进行了XRD结构分析和恒流充放电测试. 实验和计算结果表明: 随锂离子嵌入正极(电池放电),...
摘要 用H^+和NO3^-离子选择电极组成的电池用电势法测定了HNO3-UO2(NO3)2-H2O系统在25°C时的HNO3的平均活度系数, 求得了同时含有^E0和 ^S0-I关系式的Pitzer方程中的两粒子和三粒子作用参数(^s0(0), ^s(1),Ψ)。用Pitzer方程计算了该系统中水的活度, 并用Pitzer方程、Mckay-Perring方法和Harned方程分别计算了系统中HNO3...
摘要 采用DFT(B3LYP)方法,分别在6-311g(d,p),6-311++g(d,p)和自洽相关基组cc-pVIZ水平上优化了基态硝基甲烷和自由基H,OH,CH3,CH2[^3B1]以及O[^3P]等发生吸氢反应时的过渡态结构,并计算了反应的位垒。研究表明,对同一反应,不同基组下优化得到的过渡态几何结构基本一致;反应位垒数值的大小也基本接近,经校正,硝基甲烷同自由基反应位垒的理论计算值同实验...
CH2O+H→CHO+H2反应途径和变分速率常数计算研究     甲醛  从头计算法  过渡态理论  反应速度常数         font style='font-size:12px;'> 2007/12/19
摘要 采用QCISD/6-311G^**从头算方法,优化了吸氢反应CH2O+H→CHO+H2的反应物、过渡态、产物几何结构,得出该反应的正、逆反应活化位垒分别是35.4kJ/mol和98.8kJ/mol。沿IRC分析指出该反应是一个C—H键断裂和H—H键生成协同进行的反应,而且在反应途径上存在一个引导反应进行的振动模式,这一反应模式引导反应进行的区间在—0.4~0.55(amu)^1/2之间。在3...
摘要 在60℃和恒定离子强度下,用平衡pH法研究顺丁烯二酸存在下Cr^3^+的水解和聚合作用.Cr^3^+和顺丁烯二酸同时以三种不同的浓度0.006,0.008和0.01mol.dm^-^3存在,Cr^3^+在水溶液中的状态用作图法和pqr分析法测定,发现有如下粒子存在:[CrA]^+,[Cr(OH)A],[Cr~2(OH)~2A~3].作图法的结果用计算机进行修正,计算了约50个数据点.所有粒子...
摘要 C60富勒烯键联哌啶荒酸1和7-氯代吩嗪2是C60富勒烯与二烯体经Diels-Alder环加成获得,用纳秒激光光解技术研究了给电子基团键联C60富勒烯衍生物的三线态物理特性. 在苯腈溶液中在近红外区通过瞬态谱观测了激发三线态.用半经验方法AM1计算了化合物1和2的前线分子轨道HOMO 与 LUMO.关于化合物1和2的分子内电荷转移,理论计算与纳秒时间分辨瞬态谱得出基本相符的结果.
摘要 4-氨基-1,2,4-三唑-5-酮(ATO)与硫氰酸钾、氯甲酸乙酯在乙酸乙酯中反应, 合成了4-(1,2,4-三唑-5-酮-4-基)-3-硫代脲酸乙酯, 在室温下采用缓慢蒸发溶剂二甲基甲酰胺得到合适的可用于X射线衍射的单晶. 晶体属六方系, 空间群为R-3, 晶体结构参数为a=2.60524(7) nm, b=2.60524(7) nm, c=0.82579(6) nm, γ=120°, V...
LiF-KF熔盐溶液局部结构的计算机模拟研究     计算  计算机模拟  氟化钾  氟化锂  熔盐  蒙特卡罗模拟  同离子系  位能         font style='font-size:12px;'> 2007/12/19
摘要 本文用Monte Carlo法对同离子系LiF-KF熔盐溶液的局部结构进行了计算机模拟,介绍了计算方法和模型。计算了LiF, KF及Lif-KF混合前后正-正离子, 正-负离子, 负-负离子间位能变化, 各类离子的近邻离子排布规律, 以及各种形式离子团的组成比例。本文还讨论了在熔盐瞬时结构中存在的静电场的微区涨落。
摘要 本文用Monte Carlo法对互易盐系LiF-KCl熔盐溶液的局部结构作了计算机模拟。计算了该熔盐溶液的总势能和势能分布。在1200K模拟温度下, 该熔盐溶液中大部份离子组成各种形式的离子团。根据模拟的互易盐系熔盐溶液模型, 讨论了熔体局部结构和物性之间的关系。
摘要 用从头算方法研究了H+HNCO→NH2+CO的反应机理: 首先经过H2NCO中间体,并为反应的控制步骤。在此基础上, 计算了控制步骤的反应途径, 沿反应途径的动态学性质和正则变分过渡态理论的速率常数。结果表明, 反应存在返回效应和隧道效应, 反应途径的曲率对隧道效应影响较大, 用变分过渡态方法和小曲率近似方法分别进行校正是有效的。
摘要 从头计算了FeS2Cl4二价负离子,证实了Fe3d为主的分子轨道不处于前沿地位,而是属于S和Cl孤对能级原子布居数表明铁原子是4s电子的强给予体,3d电子的弱接受体,但是硫和氯原子都是P电子接受体.
摘要 用从头算和密度泛函数理论研究了1,3-二氟丙烷的构象和电子结构。在计算的各种理论水平下,GG构象是最稳定构象,AG构象次之。利用分子力场的非键作用定量化旁式效应,由MM2力场的非键参数计算的结果较为合理。对于GG和AG构象,在HF/6-31G^*和HF/6-31+G^*^*水平预测的构象分布与实验值接近。
摘要 采用HF/3-21G方法, 对6种气相和水相中可能存在的5-氟尿嘧啶(和5-氯尿嘧啶)互变异构体进行了构象分析.采用B3LYP/6-311+G**方法对处于优势构象时的各互变异构体进行了几何全优化, 并计算出它们的总能量、焓、熵、吉布斯自由能. Onsager反应场溶剂模型用于水相的计算. 计算结果表明, 5-氟尿嘧啶和5-氯尿嘧啶在气相中和水相中主要以双酮形式存在. 5-氟尿嘧啶和5-氯尿...
摘要 采用BH-HLYP/6-311+G**方法对10种气相和水相中可能存在的5-氟胞嘧啶互变异构体进行了几何全优化, 并计算出它们的总能量和吉布斯自由能. Onsager反应场溶剂模型用于水相的计算. 计算结果表明, 5-氟胞嘧啶在气相中主要以烯醇式-氨基式形式存在, 在水相中主要以酮式-氨基式形式存在. 溶剂化自由能与异构体的气相偶极矩存在相关性.进一步求得互变异构化以及构象异构化和顺反异构化...

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