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中国林业科学研究院基于基因组学和群体遗传学揭示沙棘染色体进化及重要活性物质的驱动作用（图）
群体遗传学 沙棘染色体进化 活性物质
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2022/10/30
2022年3月11日，林业所在沙棘染色体进化及重要经济性状的调控机制研究方面取得新进展。相关成果以《Genome sequence and population genomics provide insights into chromosomal evolution and phytochemical innovation ofHippophae rhamnoides》（基于基因组学和群体遗传学揭...
鱼类群体运动的元胞自动机模型中的最小势能原理
鱼类 群体运动 最小势能 元胞自动机
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2024/1/22
群体运动是自然界中一种常见的生物行为.在一定的环境条件下,社会有机体会表现出不同的集体运动形态.其中,旋转是鱼群中常见的群体运动.但是,虽然研究人员对鱼群的运动进行过一系列的研究,这种旋转行为的机理尚不清楚.本研究假定鱼群的运动模式受势能的支配,相应提出了鱼类个体运动的势函数并将之融合到元胞自动机中以模拟鱼群的运动.数值模拟表明,有限空间内鱼群运动时会形成多种形状,但当此生物系统按照能量最小原则发...
九孔鲍选择群体F1的选择反应与现实遗传力估计
九孔鲍 群体选育 选择反应 现实遗传力
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2014/4/4
以中国九孔鲍（Haliotis diversicolor aquatili）养殖群体与日本野生群体杂交子二代为选育基础群体，采用群体选育方法进行九孔鲍的选择育种研究，以估计该养殖群体的选择反应与现实遗传力。截断选择壳长最大的10%个体作为选择组亲本（SS），从基础群体中随机抽取相同数量的个体作为对照组亲本（SC），选择强度为1.755，结果表明，选择组与对照组在卵径、受精率方面无显著的差别（P>0...
雪峰乌骨鸡自然群体遗传多样性的微卫星分析
雪峰乌骨鸡 微卫星标记 多态信息含量 杂合度
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2009/9/22
雪峰乌骨鸡是具有独特遗传特性的优质肉药兼用地方家禽品种。为了评价雪峰乌骨鸡现有品种资源的遗传背景、群体遗传结构等, 提出合理的保种方法和措施, 本研究筛选了家鸡基因组23条染色体上的23个微卫星标记, 对采自湖南怀化的50只纯种乌骨鸡个体进行了多态性检测。结果表明: 23个微卫星座位共检测到79个等位基因, 所有座位都呈现出多态性, 每个座位的等位基因数在2–6个之间, 平均为3.435个。群体...
5个泥蚶群体遗传多样性的RAPD分析
泥蚶 RAPD 遗传多样性 亲缘关系
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2009/9/11
采用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术，对5个泥蚶群体的遗传多样性进行了研究。在选择的20个随机引物中共检测到154个扩增片段，长度在300 bp~2300 bp之间，每个个体扩增条带在1~11条不等。利用Popgen 3.2和PHILIP统计软件，获得实验数据，确立了5个群体间的亲缘关系。结果表明：（1）泥蚶的5个地理群体分化不明显，没有形成不同的地理种群；（2）聚类分析显示，韩国群体与浙江群...
湖北海棠的等位酶变异和遗传多样性研究
居群遗传学 基因频率 遗传结构 基因流
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2009/9/11
采用超薄平板微型聚丙烯酰胺等电聚焦电泳方法对湖北海棠（Malus hupehensis）的9个野生居群和2个人工栽培居群的等位酶变异和遗传多样性进行了初步研究。通过对12个酶系统29个酶位点的检测，结果表明湖北海棠有25个酶位点的等位基因频率分布差异非常显著，有10个居群发现稀有等位基因，并有11个（37.9%）重复位点；湖北海棠的遗传多样性水平很高，等位基因平均数A=2.127、多态位点百分率...
群体遗传学研究中的数据处理方法Ⅰ.RAPD数据的AMOVA分析
群体遗传结构 RAPDistance DCFA 进化距离
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2009/9/11
近年来，RAPD数据和AMOVA分析广泛地应用于群体遗传学和保护遗传学研究。然而，由于RAPD标记具显性特点，加上目前进行AMOVA分析所依赖的RAPDistance软件不完善，使得对RAPD数据进行AMOVA分析时存在许多不足。本文介绍了AMOVA分析的基本过程，同时引入一个新的程序DCFA用以替代RAPDistance，并详述了将DCFA与WINAMOVA联用，对RAPD数据进行AMOVA分析...
采用超薄平板微型聚丙烯酰胺等电聚焦电泳方法对三峡库区特有种疏花水柏枝（Myricaria laxiflora）的13个自然居群和1个人工迁地保护居群的等位酶遗传变异进行了初步研究。检测了5个酶系统，得到13个等位酶位点，遗传多样性及其遗传结构分析结果表明：疏花水柏枝具有较高水平的遗传多样性，平均多态位点比率P=78.7%，每位点平均等位基因数A=1.8，平均预期杂合度He=0.317，高于中国植...
采用等位酶淀粉凝胶电泳技术对西藏雅鲁藏布江中游砂生槐（Sophora moorcroftiana） 10个天然居群的遗传多样性进行了研究。13个酶系统24个酶位点（46个等位基因）的检测结果表明，砂生槐具较低的遗传变异水平。居群水平上的遗传多样性指标分别为：多态位点百分率Pp＝25.0%～37.5%，等位基因平均数Ap＝1.3～1.7，平均期望杂合度Hep=0.112～0.169；种水平上的遗传多...
生物入侵是不均衡世界的一个永恒话题，尤其是当人类有意或无意地引入物种后。很多引入显然是无害的，但另外一些则有着严重的后果，会给入侵地的生物以至于整个生物群落造成影响。本文总结了分布区扩张的常见模式，概述了它们对遗传多样性和种群结构式样所造成的影响。描述了如何根据以一批遗传标记所得到的遗传多样性式样来推断入侵途径，来揭示伴随扩张选择和漂变在形成种群遗传样式中的作用。本文对日益增多的群体遗传学方法进行...
一个实用的群体遗传学分析软件包——GENEPOP 3.1版
群体遗传学 软体包
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2009/9/10
GENEPOP是一个非常实用的群体遗传学分析软件包，适用于对大量的群体遗传学数据进行分析。它主要有以下3个方面的用途：1)进行正合检验，如对哈迪_温伯格平衡、种群差异和位点间的连锁不平衡进行检验；2)估算经典的群体遗传学参数，如Fst和其它相关指数及基因频率等；3)可把GENEPOP的输入文件转换为其它常用的群体遗传学分析软件包(如BIOSYS、FSTAT和LINKDOS)所要求的输入文件格式。...
利用45对微卫星分子标记（SSR），以草鱼(Ctenopharyngodon idellus)自然群体为实验材料，探讨野生群体遗传多样性研究中所需的最适样本量与标记量。实验设置6个样本量梯度，9个标记量梯度。对等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、观察杂合度（Ho）、期望杂合度（He）等遗传多样性指标的变化趋势进行统计分析。结果表明，样本量、微卫星标记的数量和多态性水平对群体遗传多样性均有...
大河猪是中国西南中海拔地区代表性猪种之一，长期以来在当地养猪生产中发挥了重要作用。为了阐明其群体遗传变异情况，为进一步有效保护和合理利用提供科学依据，采用分布在家猪19对染色体上的76个微卫星标记对该猪种60个随机抽样个体进行了微卫星PCR–聚丙烯酰胺凝胶电泳检测。共检测到347个等位基因，所有座位都呈现出多态性，每个座位的等位基因数在3—10个之间，平均每个座位等位基因数4.57个，有效等位基因...
德宏水牛是云南省地方水牛的优良品种之一，为了进一步阐明其群体遗传变异和遗传结构，筛选了分别位于水牛14条染色体上的15对微卫星引物，对德宏水牛81个个体进行了检测分析。共检测到62个等位基因，每个座位等位基因数目从2到6个不等，平均等位基因数为4.13，该水牛群体期望杂合度和多态信息含量分别为0.6520±0.1526和0.5863±0.1789，各座位的遗传分化系数在0～0.0919之间，平均值...