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一种限制性cDNA文库的构建     cDNA文库  克隆       font style='font-size:12px;'> 2008/1/3
利用本室创建的限制性显示技术RD-PCR,建立的cDNA文库,我们称之为限制性cDNA文库。该方法构建的文库因经过了限制性分组扩增,每组均含有特定的cDNA,因而大大加快了随后克隆的分离和鉴定的速度。
一种适用于线粒体基因表达分析的cDNA-RAPD方法     线粒体  RAPD  随机六聚体       font style='font-size:12px;'> 2008/1/3
由于植物线粒体DNA分子结构复杂,并在与细胞核共进化的过程中形成了自己独特的表达系统,迄今仍没有一种较好的能够对植物线粒体基因表达进行分析的方法。本文依据线粒体RNA的自身特点,对已用于分析真核mRNA的差展方法进行了改进。采用随机六聚体引物取代oligo(dT)n,从而将线粒体RNA及其他各类无poly(A)尾的mRNA纳入到可直接研究的范围,发展了一种适用于线粒体基因表达分析的方法。
发现新基因的高效方法——cDNA文库的复性式均一化技术     cDNA文库  均一化  复性       font style='font-size:12px;'> 2008/1/3
由复性式均一化技术制作的均一化cDNA文库(equalized cDNA library,normalized cDNA library)是近年来发展起来的一种获得EST、发现新基因的高效平台。本文就该技术的原理、方法比较、存在问题和展望进行了阐述。
大多数有重要功能的蛋白质都含相应的由保守氨基酸顺序组成的功能结构域。本文首先根据蛋白质功能结构域保守氨基酸序列设计简并引物,用PCR方法扩增出基因EST序列,再利用改进的快速扩增cDNA末端(RACE)方法从cDNA文库中扩增出基因非同源部位,然后以非同源序列为探针,筛选cDNA文库。利用此方法成功地从人骨髓cDNA文库中克隆到几个编码锌指蛋白并代表原有EST的新的全长cDNA。这一策略也应适用于...
正常人体淋巴细胞cDNA文库的构建     cDNA文库  构建  外周血  淋巴细胞       font style='font-size:12px;'> 2008/1/3
应用GIBCOBRL建库试剂盒建立了正常人体淋巴细胞cDNA文库。取新鲜的正常人外周血,分离出淋巴细胞,进行体外培养,提取总RNA,纯化mRNA,并将其反转录成cDNA,与SalI和NotI接头连接后插入λZipLox载体,体外包装后转染到Y1090宿主菌中,进行滴度测试及文库扩增。构建的正常人淋巴细胞cDNA文库含2-6×106重组子,克隆效率为5×1012重组子/g cDNA,插入片段长度约为...
用suc2信号肽捕获系统筛选小鼠胚胎cDNA文库基因     cDNA文库筛选  非编码RNA  蛋白质分泌       font style='font-size:12px;'> 2008/1/3
摘要 PCR扩增 1 1d小鼠胚胎cDNA文库插入片段 ,将 0 .5~ 2 0kb的扩增产物插入筛选载体的多克隆位点 ,转化suc2基因缺陷酵母宿主菌 .然后将约 1 0 5个酵母菌落接种于选择性平板上进行筛选 ,得到了 1 82个可在选择性培养基上生长的菌落 .PCR扩增显示 ,插入片段大小分布于 0 1~ 1 5kb之间 .对其中 1 4个阳性菌落的重组子进行序列测定 ,分别代表 6种...
一种苦荞主要过敏原基因cDNA的克隆及序列分析     苦荞  过敏蛋白  3′-RACE  克隆与序列分析       font style='font-size:12px;'> 2008/1/3
摘要 为了获得苦荞中主要过敏原的cDNA和由此推导的蛋白质序列 ,分析其结构特点 ,以苦荞幼根根尖为材料 ,提取总RNA并反转录mRNAcDNA第一链 .通过RT PCR、3′RACE、基因克隆及序列测定 ,获得一种苦荞主要过敏蛋白基因的cDNA片段 (GenBank登录号为AY0 4 4918) .该cDNA片段由 76 8bp组成 ,包括 3′端非编码区 180个bp ,开放阅读框 5 88...
一种cDNA克隆的简易方法     双分子质粒  载体-引物  人胚cDNA文库       font style='font-size:12px;'> 2008/1/3
摘要 构建了一种适用于克隆cDNA的双分子质粒载体。使用此载体,以载体引物合成ds-cDNA后,用连接酶将cDNA-载体重组子自身环化,转化宿主菌。本文以此方法构建了人胚胎组织cDNA文库,转化菌中约50%含有cDNA插入片段。此方法大大简化了cDNA克隆步骤,提高了克隆效率。
摘要 首先构建了东亚钳蝎毒腺组织 c DNA文库 ;根据已知的东亚钳蝎哺乳动物毒素氨基酸序列保守区设计引物 ,并用 PCR从 c DNA文库中扩增出一个 c DNA片段作为筛选 c DNA文库的探针 ;从 c DNA文库中筛选到二个编码同一个新的蝎毒素多肽的 c DNA,它们除 3′- UTR外 ,其余序列完全一致 .它们均含有 2 55bp长的开放阅读框 ,编码 85肽的前体毒素 ,包括 1 9...
摘要 为研究碱性磷酸酶(EC 3.1.3.1; alkaline phosphatase,ALP)在牙鲆(Paralichthys Olivaceus)发育和变态中的作用,采用RACE的方法克隆了牙鲆ALP基因cDNA全长,通过生物信息学分析了核苷酸序列并进行蛋白结构预测. 结果表明,牙鲆ALP cDNA全长为1 811bp,能编码476个氨基酸的蛋白质,分子量为52 293.1,等电点为7...
摘要 应用抑制性差减杂交技术 ( SSH)克隆两种不同小鼠胸腺基质细胞的差异表达基因 ,获得新基因片段 C55.通过 Gen Bank检索及 RT- PCR扩增出一个全长 1 .4kb的 c DNA.杂交分析认为它是一个完整的 c DNA序列 .c DNA序列分析表明 ,它拥有一个 636bp的开放读码框架 ,编码 2 1 2个氨基酸 .同源序列比较发现 ,它编码一个肌动蛋白相关蛋白的新成员 ,该...
摘要 在通过大规模 ESTS技术对垂体基因表达谱的研究中 ,从垂体组织产生了 72 2 2个 ESTS,有385个 ESTs是代表生长激素 (GH)基因的 ,其中 1个为中间缺失 1 38bp的 GH异形体基因 ,并经巢式 RT- PCR及测序证实 ;该基因编码 1 71个氨基酸的前肽 ,去除信号肽后 ,其成熟肽由 1 45个氨基酸组成 ;经生物信息学处理 ,其分子量大小约 1 7k D;与正常生...
摘要 在完成小花棘豆毒素 95 %氨基酸序列的基础上 ,根椐已知的氨基酸序列 ,设计合成了特异简并引物 .以小花棘豆总RNA为模板 ,逆转录合成cDNA第一链 ,用置换法合成双链cDNA .用特异引物对此双链cDNA进行PCR扩增 ,将扩增后的目的基因与用SmaⅠ酶切的质粒pUC 18连接 ,转化大肠杆菌JM10 7.筛选阳性克隆进行序列分析 ,获得了OXY基因的全部序列 .经测序后测得基因序列与...
摘要 为了探讨出血毒金属蛋白酶结构功能关系 ,通过 RT- PCR方法 ,从皖南尖吻蝮蛇( Agkistrodon acutus)毒腺总 RNA中扩增得到编码 P- 型出血毒金属蛋白酶的完整类去整合蛋白和富含半胱氨酸两个结构域 c DNA( AA/DC) .它全长 964bp的 c DNA,开放阅读框架编码 2 1 6个氨基酸残基 ,序列比较分析表明它同来自 Bothrops jararaca的...
快速简便筛选cDNA文库的SSS法SSS Method for Screening cDNA Library     SSS法  cDNA文库  PCR  文库筛选       font style='font-size:12px;'> 2007/12/31
摘要建立了一种快速简便筛选cDNA文库的方法—SSS法(subsection screening)。该方法用cDNA噬菌体平板划块分组和根据目的基因设计的一对特异性引物,用PCR技术逐级筛选cDNA文库获得目的基因。与其它筛选cDNA文库的方法相比,该方法范围可控,目标明确,易于获得目的基因,而且快速、简捷、省时,一般可在一周内筛选出目的基因。本实验室利用该方法在半个月内筛选出了一个查耳酮异构酶(...

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