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棉铃虫中肠cDNA文库的构建及EST分析
棉铃虫 中肠 cDNA文库 表达序列标签(EST) 序列分析
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2011/12/1
中肠是苏云金芽孢杆菌Bacillus thuringiensis (Bt)发挥作用的主要部位, 中肠上很多蛋白被认为是Bt毒素的结合蛋白。为了探索棉铃虫Helicoverpa armigera对Bt的抗性机制, 我们运用RNA转录过程中的5′末端转换机制(Switching Mechanism at 5′ end of the RNA Transcript, SMART)技术构建了棉铃虫中肠的cD...
鸡卵巢组织SSH cDNA文库构建及差异表达基因筛选与初步鉴定
鸡 cDNA 文库 卵巢组织 差异表达基因 抑制性消减杂交
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2011/10/21
为分离与鸡产蛋性能密切相关的重要基因或调控因子,利用抑制性消减杂交技术,以高产蛋鸡品种海兰褐商品代蛋鸡和产蛋量相对较低的地方鸡品种大骨鸡20周龄时的卵巢组织为试验材料,构建消减cDNA 文库。文库的插入片段集中在500 bp 左右,挑取720 个克隆进行PCR 筛选,获得657 个阳性克隆,经过点杂交筛选后选择了536个阳性克隆,从中随机挑取100个阳性克隆进行测序。经过同源性比对归并后得到52个...
酰基辅酶A结合蛋白(acyl-CoA-binding protein, ACBP)对长链脂酰基辅酶A(long-chain fatty acyl-CoA esters, LCACoA)有很高的亲和力, 因而对LCACoA在细胞内的运输和利用过程起重要的作用。本文采用RACE 技术从鲈鱼肝脏中克隆了Acbp 基因的全长cDNA 序列, 该基因全长cDNA 679 bp, 5’ 端和3’ 端的非翻译区...
西方蜜蜂表皮蛋白基因apd-like转录起始位点的定位及cDNA序列的分析
西方蜜蜂 5′LongSAGE 表皮蛋白 apd-like基因 转录起始位点(TSS)
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2011/12/22
Apidermin蛋白家族是根据蜜蜂表皮蛋白apidermin 1-3(APD 1-3)而命名的一个新型的昆虫结构性表皮蛋白家族。为了鉴定西方蜜蜂Apis mellifera基因组序列上毗邻基因簇apd 1-3的一个预测基因座LOC727145是否为一个新的apd基因,本研究在用5′LongSAGE标签定位该基因的转录起始位点(TSS)的基础上,利用其中的3条5′LongSAGE标签序列作为上游引...
鳜肌酸激酶M-CK cDNA的克隆与组织表达分析
鳜 肌酸激酶 cDNA末端快速扩增 组织表达
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2010/4/20
利用RT–PCR和cDNA末端快速扩增法(RACE)克隆了鳜(Siniperca chuatsi)肌酸激酶(creatine kinase,CK)cDNA序列,并分析了该基因的结构特征和系统关系。鳜CK cDNA序列全长1586 bp,包括5′端非翻译区92 bp,3′端非翻译区348 bp和开放阅读框(ORF)1 146 bp,共编码381个氨基酸。鳜CK具有脊椎动物CK共有的保守结构域和肌型肌...
北极狐GHR基因cDNA的克隆及序列分析
北极狐 GHR 基因 克隆 序列分析
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2016/7/20
本文根据狗(AF133835)的GHR 基因cDNA 编码全序列设计了三对引物,利用RT - PCR 方法克隆出北极狐GHR 基因编码区全长cDNA 序列(GenBank accession No. EU304325)。结果表明,北极狐GHR 的ORF 为1 917 bp,编码638 个氨基酸的前体蛋白,由18 个氨基酸的信号肽和620 个氨基酸的成熟肽组成。通过同源性比较发现北极狐与狗的同源性最...
秀丽小杆线虫Caenorhabditis elegans pkc-2基因cDNA的克隆和表达
秀丽小杆线虫 pkc-2基因 cDNA克隆 免疫细胞化学
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2009/11/25
蛋白激酶C在秀丽小杆线虫中具有调节肌细胞渐进性萎缩的功能.为了揭示它的调节机制, 本研究克隆了秀丽小杆线虫中蛋白激酶C pkc-2基因的cDNA pkc-2-c,构建了含该pkc-2基因cDNA亚型的重组质粒pPD 118.20-pKG 63;揭示了该cDNA在秀丽小杆线虫体壁肌细胞中的定位.
Cloning and Bioinformatics Analysis of TIR1 cDNA from Super Hybrid Rice Parental Line 1S
生长素受体 生物信息学 超级杂交水稻 TIR1
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2009/11/18
生长素受体TIR1通过形成SCFTIR1复合体与生长素直接结合, 即为Aux/IAA在26S 蛋白酶体降解过程中的关键蛋白质。在Blas t检索和生物信息学分析的基础上设计特异引物, 以超级杂交水稻(Oryz a sativa)亲本株1S为材料, 通过RT-PCR扩增并经T-A克隆后测序, 获得一条长度为2 219 bp 的序列, 其开放阅读框长度为1 764 bp, 编码含587个氨基酸残基的肽...
斑马鱼Cyclin C的cDNA克隆及其在发育过程中的表达
周期蛋白C 表达 斑马鱼 胚胎发育
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2009/11/2
细胞周期蛋白C(cyclin C)与细胞周期依赖性蛋白激酶cdk8结合,通过磷酸化RNA 聚合酶 II 和 TFIIH调控转录.在脊椎动物胚胎发育过程中有关细胞周期蛋白C合子型转录激活机制尚知甚少.本研究克隆了斑马鱼细胞周期蛋白C基因,并用Northern杂交和整体原位杂交技术检测其在胚胎发育过程中的表达状态.结果显示,斑马鱼细胞周期蛋白C高度保守,与人细胞周期蛋白C有88%的蛋白序列同源;斑马鱼...
Mest基因是一种印记基因,在人、小鼠以及其他的哺乳动物和有花植物中都有研究报道。为了更好地研究该基因的功能和进化特点,利用RACE法获得了中华大蟾蜍Mest基因(BgMest)的cDNA全长序列(1 325 bp),它包含一个完整的ORF,可编码326个氨基酸的多肽(GenBank登陆号:ABQ10905)。多肽链中包含一个典型的α/β水解酶折叠结构域,其在氨基酸水平上与热带爪蟾和一些哺乳动物分...
肉色伪角毛虫(纤毛门,腹毛目)的cDNA文库构建及部分EST序列分析
海洋纤毛虫 肉色伪角毛虫 cDNA文库 EST序列 功能注释
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2009/8/26
以海洋腹毛类纤毛虫-肉色伪角毛虫为材料开展了cDNA文库的构建和部分基因表达序列标签(EST)的分析。其中,利用Smart技术构建cDNA文库,质量检测表明该文库容量为1×106 pfu/mL,重组率为91%,表明所建文库能够满足后续的EST文库构建及从文库中分离筛选重要基因等研究工作。从该库中随机抽取了237个克隆进行5′端测序,拼接后得到189条非冗余基因(UniGene),Blast X比对...
芳香化酶(P450arom)是雌激素合成过程中的关键酶,在性别分化中起重要作用。鱼类存在卵巢性和脑型两种芳香化酶,分别由Cyp19a和Cyp19b编码。稀有鮈鲫作为我国特有的实验动物,尚无其芳香化酶的有关资料,其性别分化机制亦不清楚。本研究采用RT-PCR的方法以简并引物扩增了稀有鮈鲫脑型芳香化酶基因Cyp19b的部分序列,其长度为1070 bp, 编码357个氨基酸残基,具有典型的芳香化酶结构域...
甘菊BADH基因cDNA的克隆及在盐胁迫下的表达
甘菊 盐胁迫表达 cDNA克隆
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2009/8/4
甘菊BADH基因cDNA的克隆及在盐胁迫下的表达。
cDNA基因芯片技术分析三聚氰胺肾毒性的相关基因表达
三聚氰胺 基因芯片 肾毒性 肾结石
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2010/4/19
利用基因芯片技术筛查不同剂量的三聚氰胺干预大鼠肾脏的差异表达基因, 并对筛查的差异基因进行生物信息学分析, 推测三聚氰胺肾毒性的分子作用机制. 结果表明, 高剂量三聚氰胺干预的大鼠肾脏差异表达基因数多于低剂量干预的肾脏差异表达基因, 并且涉及到更多重要的分子功能和代谢途径, 表明三聚氰胺肾毒性具有剂量依赖性, 相比低剂量而言, 高剂量三聚氰胺干预对肾脏的危害更为严重.
半滑舌鳎FTZ-F1 cDNA克隆及表达分析(英文)
半滑舌鳎 FTZ-F1 cDNA克隆 表达
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2009/6/25
为研究性别相关基因FTZ-F1在半滑舌鳎鱼中的表达特征,采用同源克隆策略,从其精巢分离了3 143 bp长的半滑舌鳎FTZ-F1(hsFTZ-F1)的全长cDNA,该序列包含1 458 bp开放阅读框,66 bp长的5’末端非编码区(UTR),1 619 bp长的3’末端UTR。mRNA的组织分布、氨基酸序列和系统发生分析表明:hsFTZ-F1属于SF-1/Ad4BP类群。RT-PCR分析表明:h...