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中华鲟铁蛋白基因cDNA全长克隆与组织表达分析(英文）
中华鲟 铁蛋白 生物信息学
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2009/6/19
根据铁蛋白基因的保守序列，搜索GenBank数据库中华鲟的EST数据库得到一条同源序列。通过RT-PCR的方法对该序列进行扩增，修改其测序错误，获得中华鲟铁蛋白亚基cDNA全长，经过注释提交GenBank数据库，获取序列登录号EU348782。该cDNA长度为896 bp，包含531bp的完整编码区，推测编码的蛋白质为176 aa，分子量为20339.9 Mr，理论等电点为5.66。它和大西洋鲑鱼...
本项研究以雌性草鱼肠道为实验材料，采用非均一化的Oligo—dT引物定向克隆技术构建了草鱼肠道组织的
cDNA文库，对文库质量的分析结果表明：cDNA文库的库容量至少为2．3×lo5，重组率达95％ ，平均插入片断长度
大于1000bp。挑取cDNA克隆进行5’端测序，总共进行了1571个成功反应，其中l4ll条ESTs长度大于100bp，初步
拼接得到939个单基因簇(Unigene)，其...
大海马垂体糖蛋白激素α亚基的cDNA克隆和序列分析
大海马 糖蛋白激素a亚基 eDNA克隆
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2009/6/3
大海马(Hippocampus kuda Bleeker)隶属鱼纲海龙目，是一种名贵的海产中药材，也是重要的海洋保护鱼类。我
们通过快速扩增eDNA末端(rapid amplification of eDNA ends，RACE)的方法，首次从大海马的垂体总RNA中扩增出其
垂体糖蛋白激素a亚基(pituitary glyeoprotein hormone a subunit，PGH a)全长...
以花鳗鲡脑组织为材料，提取总RNA，应用CloneminerTM文库构建试剂盒构建cDNA文库。经检测，文库的滴度为4.3×106 cfu/mL，总容量为5.16×107 cfu/mL，阳性克隆率为99.6%，插入片段0.43－3.2kb之间，平均插入片段大小为1532bp。以文库为模板，克隆获得花鳗鲡两种类型的促性腺激素释放激素（mGnRH和cGnRH-II）cDNA序列。序列分析表明，花鳗鲡m...
cDNA基因芯片技术已广泛应用于生物物种间功能基因组和表达谱学研究。然而，鱼类基因芯片开发和应用相对落后。为了筛选与肉质性状相关功能基因，本研究首次试用异源斑马鱼基因cDNA芯片，对两种肉质性状明显差异的鳜鱼和鲢鱼肌肉组织中基因表达进行了比较分析。从两种鱼肌肉组织中提取总RNA，经Biotin荧光标记与拥有15617个cDNA片段的斑马鱼基因芯片（Affymetrix）杂交后，检测出375个表达基...
蒙古红鮊肥胖基因cDNA的克隆与组织表达特异性研究
蒙古红鲔 ob基因 leptin 组织
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2009/6/3
本文根据已知的人和鼠o6基因序列设计引物，采用RT-PCR(reverse transcriptase—polymerase chain reaction)技
术，从蒙古红鲔脂肪组织RNA中扩增到o6基因片段，获得o6基因编码区438bp的序列。与人和其他动物比较，蒙
古红鲐与人、猪和鼠o6基因核苷酸编码序列的同源性分别为82．9％、84．0％和99．1％，蒙古红鲐o6基因编码的蛋
白lep...
鲫鱼低氧相关基因差减cDNA文库的构建与分析
鲫鱼囊胚细胞 低氧相关基因 抑制性差减杂交
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2009/6/3
鲫鱼对低氧具有极强的耐受性。在低氧状态下鲫鱼鳃瓣表面积增加，无氧代谢增强，能量消耗降低。但是人们对鲫鱼产生这些低氧反应的分子机理还缺乏了解。本研究以1%低氧处理24h的鲫鱼囊胚细胞(CAB)作为检测子(Tester)，常氧条件下培养的CAB细胞作为驱赶子(Driver)，分别提取总RNA，利用SMART cDNA 技术合成双链cDNA，经差减杂交和抑制性PCR扩增获得差减PCR产物。然后将差减P...
鲤鱼肝胰脏cDNA 文库的表达序列标签分析及Lb-Fabp mRNA的特征
鲤鱼 cDNA文库 表达序列标签 脂肪酸结合蛋白 mRNA表达
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2009/6/3
本文构建了鲤鱼肝胰脏cDNA 文库，共获得了1016条有效的表达序列标签。拼接组装成115 个contigs和282 个singletons。其中215个拼接序列在GenBank公共数据库中寻找到相对应的基因。对它们进行功能性分类和比较分析为鲤鱼肝胰脏的研究提供了基因表达信息的基础。文库中1016条表达序列标签有11条代表了鲤鱼肝基本型脂肪酸结合蛋白(Lb-FABP)。通过序列比较我们获得了两个具...
团头鲂促性腺激素β亚基cDNA的克隆和序列分析
RT—PCR RACE 克隆 团头鲂 促性腺激素B亚基cDNA
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2009/6/2
本研究利用RT—PCR和RACE克隆了团头鲂(Megalobrama amblycephala)脑下垂体中两种促性腺激素B亚基
(GtH Ip和GtH IIp)cDNA序列，并对其进行了结构和系统进化分析。团头鲂GtH Ip亚基cDNA全长567碱基对
(bp)，5’端非翻译区26bp；3’端非翻译区148bp；开放阅读框(ORF)393bp，其编码含有130个氨基酸的蛋白质，包括
由108...
高山植物黄管秦艽cDNA 文库构建与表达序列标签(EST) 分析
黄管秦艽 基因组学 cDNA 文库 表达序列标签 龙胆属
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2009/5/27
黄管秦艽( Gentiana officinalis) 是一种重要的藏药高山植物, 本研究构建了该物种开花期的cDNA 文库。经检测达到中等cDNA 文库水平, 文库滴度为1 . 2×107 pfuml , 重组率95.9% , 插入片段平均长度大于500 bp。对343 个随机挑选的重组克隆进行部分测序, 获得的ESTs 经编辑后共有181 条有效序列。经生物信息学方法分析1...
cDNA Microarray Analysis of Differential Gene Expression in Boar Testes during the Prepubertal Period
Boar Testis DNA Chip Analysis Gene Expression DNA Sequence
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2016/4/29
In an attempt to understand the biochemical mechanism for the synthesis of the anabolic steroid, 19-nortestosterone, produced by prepubertal boar testes and its physiological role, normalized compleme...
不同花色矮牵牛细胞色素b5蛋白的cDNA克隆及序列分析
花色 矮牵牛 细胞色素b5蛋白(Cyt b5) 基因克隆
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2009/4/22
以云南不同花色矮牵牛的花瓣为材料,提取总RNA,用O ligo(dT)作为引物反转录合成cDNA第一链.以此为模板,用根据国外报道的矮牵牛细胞色素 b5蛋白的cDNA序列设计合成的引物进行PCR扩,均扩增到一条约450bp的片段,分别克隆到pGE M-T载体上.对重组克隆进行序列分析,结果表明所克隆到的矮牵牛细胞色素b5蛋白的cDNA的编码区均含有447个核苷酸,编码149个氨基酸残基,与国外报道...
不同抗冷性水稻中编码甘油-3-磷酸转酰酶的部分cDNA的序列比较研究
甘油-3-磷酸转酰酶(GPAT) cDNA序列比较 抗冷性 水稻
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2009/4/22
采用RT－PCR技术，以根据国外报道的几种双子叶植物的甘油-3-磷酸转酰酶的相对保守的氨基酸序列而设计的简并引物作为扩增引物，从不同抗冷性水稻品种中均扩增到一段约315bp的cDNA片段。测序结果表明它们都是编码GPAT的部分cDNA，含有315个核苷酸，编码105个氨基酸。比较它们之间的核苷酸及推导氨基酸序列，发现有一定差异，且抗冷性相差越大的品种间差异越大。抗冷性的差异可能与脯氨酸的替换有关。
康乃馨ACC氧化酶cDNA的克隆及其反义植物表达载体的构建
康乃馨 ACC氧化酶 RT-PCR 反义植物表达载体
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2009/4/15
以康乃馨(Dianthus caryophyllus L.)花瓣为材料,用改进的异硫氰酸胍一步法提取总RNA,根据已报道的康乃馨ACC氧化酶(1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid oxidase,ACO)基因的序列设计并合成一对引物,通过RT-PCR方法获得一约1.2kb特异片段,把该片段连接到pGEM(R)-T easy vector上进行测序,其全长共11...