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刘德培院士:系统生物医学将助力个体化治疗     系统生物医学  个体化治疗  基因组       font style='font-size:12px;'> 2012/6/27
中国工程院院士刘德培近日接受《中国科学报》记者专访时指出:“读懂基因组,将是后基因组时代生命科学领域面临的最具挑战性的难题之一。”而系统生物医学应用系统生物学的方法研究医学,则有助于解析基因参与的表达调控网络、系统阐述所有基因的表达调控规律,从而使个体化治疗变得可能。
模式生物小立碗藓遗传转化系统的研究进展     小立碗藓  遗传转化  载体构建  转化方法       font style='font-size:12px;'> 2012/3/26
苔藓植物小立碗藓是迄今发现的同源重组率最高的陆生植物,堪与酵母媲美,具有"绿色酵母"之称。高的同源重组频率、简单的发育模式以及单倍体配子体为主的生活史使其渐渐成为研究生物学进程和发育模式的新型模式生物。现对近年来小立碗藓遗传转化系统研究的进展进行总结和分析,为相关研究工作者充分利用这一体系提供帮助。对小立碗藓遗传表达系统的载体构建、转化方法及宿主细胞准备等方面的进展进行了综述,对小立碗藓在基因打靶...
一磷酸腺苷激活蛋白激酶 (AMPK) 是调节体内代谢平衡的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。应用酵母双杂交系统,以AMPK β1亚基作为"诱饵"蛋白,筛选均一化的人源cDNA文库,寻找与AMPK相互作用的蛋白。通过对150个阳性克隆进行验证,最终得到了63个与AMPK β1亚基相互作用的蛋白。其中,包括代谢酶、转录因子或转录相关蛋白、蛋白转运相关蛋白、GTP结合蛋白、支架蛋白、细胞周期调节蛋白、RNA结合蛋...
简要概述了线粒体基因组的结构和特点,同时基于线粒体基因组中的13个蛋白编码基因,选螳螂目、蜚蠊目、等翅目及螳目的5个种为外群,对直翅目34个种进行系统发育学研究。结果表明直翅目与外群分开,形成单系群。直翅目内部形成螽亚目与蝗亚目2个单系群。在螽亚目内部形成螽次亚目与蟀次亚目2个分支,且驼螽总科与螽斯总科形成姐妹群,但蚁蟋科与蝼蛄科形成1支,并不支持蟋蟀总科的单系性。在蝗亚目内部形成(蚤蝼总科+(...
转座子是真核生物基因组的重要组成成分。为了研究家蚕Bombyx mori长末端重复序列 (long terminal repeat, LTR)逆转录转座子的分类及进化, 本研究采用de novo预测和同源性搜索相结合的方法, 在家蚕基因组中共鉴定出了38个LTR逆转录转座子家族, 序列长度占整个基因组的0.64%, 远小于先前预测的11.8%, 其中有6个家族为本研究的新发现。38个家族中, 26...
2011年4月1日,由中科院北京基因组研究所与中科院半导体研究所共同承担的中科院重大科研装备研制项目——“模块化DNA分析系统”项目,通过专家组评审验收。该项目的完成,标志着我国在第二代DNA测序仪研发方面,形成了具有自主知识产权的高通量DNA测序技术及其系统样机,在高端生命科学仪器装备国产化方面取得了突破性进展,填补了国内空白。 2011年3月30日至4月1日期间,在中科院计划财务局缪有贵主管...
由北京大学本科生和研究生组成的科研团队在2007年获国际基因工程机械大赛(iGEM)第一名。获奖后又经过两年多的持续深入研究,在合成生物学开关相关研究中取得突破性进展,部分成果于2010年3月在英国《自然》杂志出版社子刊《分子系统生物学》[Molecular System Biology, 6 (2010) Article number 350 doi:10.1038/ msb.2010.2]上正...
伯明翰阿拉巴马大学的研究人员发现了免疫系统第一反应抗体中细胞受体的遗传学身份,这个发现为感染控制和免疫失调研究提供了新方向。由于这个发现是免疫学非常关键的一部分,所以UAB的研究人员联合日本科学家一致要求与这个抗体受体相关的基因应该重新命名,以便更好地描述它们在早期免疫反应中的角色。
系统发生分析程序MrBayes 3.1使用方法介绍     系统发生分析  贝叶斯推理法  MrBayes 3.1  使用方法       font style='font-size:12px;'> 2009/12/29
在介绍MrBayes 3.1程序基本特点以及Nexus文件准备的基础上,选取普通DNA序列、普通蛋白质序列、含编码区域的DNA序列、mRNA序列以及混合型数据文件为例分别介绍了MrBayes 3.1程序的基本使用方法,为初学者正确使用该程序提供了操作指南,同时为深入学习与掌握该程序的特殊用途打好基础。
 2009年8月3日-6日,由华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室、江南大学工业生物技术教育部重点实验室、上海交通大学微生物代谢教育部重点实验室共同主办的“生物过程与生物系统工程国际学术研讨会2009(International Symposium on Bioprocess and Biosystems Engineering 2009)”在我校逸夫楼召开。
随着越来越多的基因序列被运用于系统发育重建中, 随之产生的基因树冲突已成为分子系统发育研究中日益突出的问题。因此, 在分子系统发育研究中, 应正确理解基因树和物种树之间的差异, 充分注意和分析基因树冲突的原因, 正确解释分子系统发育的结果。本文通过一些典型实例分析了在多基因系统发育研究中引发基因树冲突的三类主要原因: 随机误差、系统误差和生物学因素。在此基础上, 对近年来兴起的系统发育基因组学进...
2009年7月20日至22日,由中美两国自然科学基金委员会等共同支持的“中美生物启发智能系统创新研讨会——材料,力学,控制以及传感器”在我校图书馆多功能厅召开。会议名誉主席、中国工程院院士杜善义教授,会议共同主席、中国工程院院士欧进萍教授,北卡罗来纳州立大学Fuh-Gwo Yuan教授,会议学术委员会主席、中国科学院院士程耿东教授,以及中美该领域相关的科学家、工程师50余人参加了会议。此...
生物对外界环境中化学物质信号的识别和感知对其生存有着极其重要的意义. 大多数哺乳动物具有两条嗅觉通路, 主要嗅觉系统(MOS)用来感受普通嗅觉信号, 而犁鼻器系统(VNS)则从异常灵敏的程度来识别小范围内特异性的化学感应信号-信息素(pheromone). 信息素是一类在同种内个体间传递的物质, 可引发群体内与个体交流和生殖相关的一系列生理和行为变化. 本文综述了对哺乳动物犁鼻器信息素感知及犁鼻器...
关于石杉科Huperziaceae植物的分类, 一直存在一些争议。在旧的分类体系中石杉科植物被包含在一个混合的石松科Lycopodiaceae和多谱系的石松属Lycopodium中。本文利用叶绿体rbcL基因和psbA-trnH基因间区序列探讨石杉科植物的系统位置及石杉科内部的分类关系, 用最大简约法和邻接法对自测序列结合由GenBank下载的rbcL及psbA-trnH基因间区序列进行系统发育...
盾腹亚纲吸虫被认为是寄生扁形动物中古老的类群,包括盾腹科、多萼科、裂杯科和皱腹科,科问系统发育关 系尚存争议。本研究收集GenBank数据库中所有的盾腹吸虫18S rRNA基因序列,测定了三种盾腹吸虫的相应序 列,分别采用最大简约法和最大似然法构建分子系统发育树。结果显示,多萼科的分类地位不成立,多萼属应还原 到盾腹科;盾腹科的盾腹亚科和杯盾亚科均非单系,吸槽列数可能是平行进化特征,不能反映...

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