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清华大学生命学院方显杨课题组合作报道长链RNA位点特异性自旋标记新方法及其应用(图)
清华大学生命学院 方显杨 长链RNA位点 特异性 自旋标记
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2020/9/23
近期,清华大学生命学院方显杨课题组与美国南加州大学化学系Peter Z. Qin教授课题组针对现有长链RNA位点特异性自旋标记技术的局限性,合作建立了长链RNA位点特异性自旋标记新方法及其应用。该标记策略的成功建立将促进电子顺磁共振技术在长链RNA的结构与动态特性研究中的应用,并推动建立长链RNA的整合结构生物学研究方案。
DNA和RNA双链稳定性差异的理论研究
半经验计算 RM1BH方法 SimuCal_SE方法 DNA 和RNA稳定性差异 氢键结合能
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2010/3/12
利用适用于分子间弱相互作用, 尤其是生物分子间的氢键相互作用的改进的半经验方法RM1BH和达到线性标度的新的半经验算法以及SimuCal_SE方法, 与自主开发的量子化学程序包SimuPac 1.0, 对4组一系列DNA和RNA碱基的氢键结合能进行了计算. 这些计算包括单一碱基类型和混合碱基类型两大类情形, 最大的原子数达到1064个. 计算结果表明, 在碱基层数较少时, DNA和RNA氢键结合能...