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PHGA-COFFEE：多序列比对问题的并行混合遗传算法求解
生物信息学 多序列比对 并行混合遗传算法 动态规划
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2007/11/1
多序列比对是生物信息学研究中的热点问题之一，它在发现序列模体(motif)和保守区域、系统发育分析、结构预测等方面具有重要的作用.针对该问题，设计了一个求解多序列比对问题的并行混合遗传算法(与之相应的软件称为PHGA-COFFEE).该算法采用COFFEE函数作为个体的适应度函数，构造了六种遗传算子，特别是设计了两种新颖的变异算子，其中一种变异算子基于COFFEE的一致性信息设计，以改善算法的整体...