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Identification of candidate genes for key fibre-related QTLs and derivation of favourable alleles in Gossypium hirsutum recombinant inbred lines with G. barbadense introgressions
海岛棉 基因组组分 遗传作图群体
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2024/5/17
该研究以渗入了海岛棉基因组组分的优质种质鲁原343为亲本，构建了包含239个重组自交系的遗传作图群体，利用SLAF标签构建了高密度遗传图谱，结合7个环境的表型数据，共鉴定104个纤维品质和产量性状QTLs，其中66个QTL共定位于19个QTL簇中。该研究团队通过进一步对鲁原343进行全基因组深度测序，解析鲁原343的遗传组成及其对纤维相关性状的遗传贡献，发现来自G. hirsutum races（...
Transcriptome and QTL analyses reveal candidate genes for fiber quality in Upland cotton
棉花 纤维发育 QTL 转录组 表达基因
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2024/5/17
本研究基于前期得到的1个F2群体、1个重组自交系群体和2个永久回交群体得到了15个在多群体或者多年分稳定检测的QTL位点。基于转录组测序，在两亲本间发育10天的纤维进行差异基因鉴定，得到了780个差异基因。通过对QTL和转录组结果联合分析，在9个QTL区间内得到31个基因，其中有9个在纤维中优异表达的基因。在这9个基因中，有7个基因在纤维伸长期高量表达，2个基因在纤维次生壁加厚期高量表达。该研究为...
The Candidate Genes Underlying a Stably Expressed QTL for Low Temperature Germinability in Rice (Oryza sativa L.)
Rice Low temperature germinability Quantitative trait locus Candidate gene Genomewide association study
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2023/4/21
Background: Direct seeding is an efficient cultivation technique in rice. However, poor low temperature germinability (LTG) of modern rice cultivars limits its application. Identifying the genes assoc...