草棉EST-SSRs的遗传评价     草棉  表达序列标签  简单序列重复  多态性信息含量  遗传作图       font style='font-size:12px;'> 2009/11/3

根据GenBank中公布的247条草棉EST序列，搜索SSR并进行引物设计。其中的25条序列含有27个SSR，1~6碱基重复类型都存在，二碱基和三碱基重复的频率较高。为了明确在A、D和AD基因组中的可转移性，依据25条序列共设计25对EST-SSR引物，其中22对引物扩增出清晰可辨的DNA条带，产生92个多态性片段，平均每对引物产生3.64个多态性片段。引物的多态性信息含量(PIC)在0.49~0...

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雷蒙德氏棉EST-SSRs分布特征及开发与利用     雷蒙德氏棉  EST-SSRs  分布  分子标记  多态性       font style='font-size:12px;'> 2013/10/17

微卫星或简单重复序列(simple sequence repeats, SSR)存在于表达序列标签(expressed sequence tags, ESTs)中. 为了在棉花中开发EST-SSR功能性标记, 利用生物信息学方法对NCBI网上公开的63485条雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii Ulbrich) ESTs序列进行EST-SSRs特征分析. 剔除冗余序列, 得到非冗余...

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