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罗氏沼虾SNP标记筛选及不同群体的遗传多样性
罗氏沼虾 SNP 直接测序法 遗传多样性
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2020/5/13
罗氏沼虾因其自身的生长优势，已成为我国重要的养殖虾类，为保证其养殖的持续健康发展，对其进行遗传多样性分析。利用罗氏沼虾性腺组织转录组测序结果，参考NCBI数据库，选取60个SNP位点，以马来西亚野生群体(MW)为样本采用直接测序技术进行位点多态性检测，得到25个(41.7%)具有二等位基因位点。并对罗氏沼虾上海(SH)、浙江(ZJ)、马来西亚养殖群体(MF)、生长快品系选育群体(BG)及MW群体5...
非标记探针HRM法在中国对虾EST-SNP筛选中的应用
中国对虾 单核苷酸多态性 高分辨率熔解曲线
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2015/6/3
利用高分辨率溶解曲线（High resolution melt，HRM），结合非标记探针技术，对中国对虾转录组EST测序序列中的118个候选SNP位点进行了位点多态性检测，获得了39个具有二等位基因多态性的SNP位点，占总候选位点的比例为33.1%。对这些SNP位点在一个48尾中国对虾群体中的多态性进行了分析，结果表明，观测杂合度Ho和期望杂合度He的分布范围分别为0.000~0.947和0.04...