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前沿丨南京农业大学人工智能学院计智伟课题组提出单细胞RNA-seq聚类新方法（图）
单细胞 RNA-seq 聚类分析 计算框架
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2023/11/29
2023年10月3日，生物学领域重要期刊Life Science Alliance在线发表了南京农业大学人工智能学院计智伟教授课题组的题为“scFseCluster: A Feature Selection Enhanced Clustering for Single Cell RNA-seq Data”的研究论文。针对同类算法普遍存在的泛化性能差或计算开销大等局限，他们开发了一种特征选择优化的单...
华中农业大学精准营养与代谢团队开发大规模RNA-seq数据质控工具MassiveQC（图）
营养 代谢 大规模RNA-seq数据 质控工具MassiveQC
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2023/6/14
2023年5月27日，华中农业大学生命科学技术学院、生物医学与健康学院精准营养与代谢团队陈振夏课题组在国际学术期刊Briefings in Bioinformatics在线发表最新研究成果，该研究基于机器学习的算法开发了可自动下载和筛选高通量测序数据的软件MassiveQC，并将其应用于黑腹果蝇的研究，通过系统整合该物种所有公开RNA-seq数据，解析基因表达动态性的调控规律和演化模式。该研究为后...
翟继先团队首次发布包含~45,000个植物公共RNA-seq文库的在线搜索平台（图）
南方科技大学生命科学学院 翟继先团队 植物 RNA-seq文库 在线搜索平台 Plant Biotechnology Journal
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2022/10/20
近日，南方科技大学生命科学学院生物系植物与食品研究所副教授翟继先课题组发布了可以方便快速查询~45,000个植物公共RNA-seq文库的在线资源（PPRD, http://ipf.sustech.edu.cn/pub/plantrna/ ），相关成果以“PPRD: a comprehensive online database for expression analysis of ~45,000...
中国农业科学院深圳农业基因组研究所开发出从unmapped RNA-seq数据中调取全长序列的新方法（图）
unmapped RNA-seq数据 动物功能基因
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2022/10/17
2022年11月27日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所动物功能基因组学创新团队在《BMC 基因组学（BMC Genomics）》杂志在线发表了题为“Baiting out a full length sequence from unmapped RNA-seq data”的学术论文，该研究发现了能挖掘unmapped RNA-seq数据中的有效信息，并调取其全长的新方法。
南方科技大学翟继先团队发布包含两万多拟南芥公共RNA-seq文库的生物大数据在线分析平台（图）
南方科技大学 翟继先 两万多 拟南芥 公共RNA-seq文库 生物大数据 在线分析平台
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2020/9/10
近日，南方科技大学生物系副教授翟继先课题组发布可以方便快速查询超过两万个公共RNA-seq文库的在线资源，相关成果以“A comprehensive online database for exploring ~20,000 public Arabidopsis RNA-Seq libraries”为题发表在植物学领域知名学术期刊《分子植物》（Molecular Plant）。过去十年，随着测序成...