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中国农业科学院棉花研究所行业标准：棉花品种真实性鉴定SSR分子标记法
棉花品种 真实性鉴定 SSR 分子标记法
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2024/5/16
本标准规定了利用简单重复序列（Simple sequence repeat, SSR）分子标记法进行棉花（Gossypium spp L.）品种真实性检测的术语和定义，缩略语，原理，检测方案，仪器设备、试剂和溶液配制，检测程序，鉴定意见和结果报告。
中国农业科学院棉花研究所出版著作：国家审定棉花品种SSR指纹图谱（图）
中国农科院棉花所 国家审定 棉花品种 SSR 指纹图谱
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2024/5/16
本书收录了2000年至2017年103个国家审定棉花品种SSR指纹信息，每个品种均提供了60个SSR核心引物位点的四色荧光指纹图谱，对这些品种的真实性鉴定、纯度鉴定及遗传分析研究具有重要参考价值。
山东省林业科学研究院成果：白蜡属品种鉴定技术规程SSR分子标记法
山东省林科院 白蜡属品种 鉴定技术规程 SSR 分子标记法
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2024/6/13
本标准规定了以白蜡（Fraxinus）幼嫩组织（叶片，芽等）为材料，利用SSR指纹图谱对白蜡已知品种进行分子鉴定的术语、原理、主要仪器和设备、试剂与溶液、操作程序和鉴定的方法。
中国科学院武汉植物园“巫山淫羊藿及其易混物种的EST-SSR分子鉴定方法”获国家发明专利授权
巫山淫羊藿 混物种 EST-SSR分子 专利授权
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2022/10/26
2022年9月28日，从国家知识产权局获悉，武汉植物园药用植物资源学科组“巫山淫羊藿及其易混物种的EST-SSR分子鉴定方法”获国家发明专利授权。专利号:ZL201910434725.4，发明人：张燕君，于东悦，梁琼，王瑛，杨路路。
亚麻木酚素含量的SSR关联分析
亚麻 木酚素 SSR标记 关联分析
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2021/3/31
为了进一步揭示亚麻木酚素含量的遗传机制，对220份亚麻核心种质进行2 a 2点重复检测木酚素含量，通过关联分析挖掘木酚素含量相关的SSR标记，为高木酚素含量的亚麻新品种选育提供基础。结果表明，220份亚麻种质木酚素含量变幅为3.24～11.76 mg/g，变异系数为20.34%，广义遗传率61.03%，2 a 2个环境条件下重复检测筛选出7份高木酚素含量亚麻品种。30个SSR引物扩增出203个多态...
基于蜜蜂球囊菌纳米孔测序数据的基因非翻译区延长、SSR位点发掘及未注释基因和转录本鉴定
蜜蜂球囊菌 长读段测序技术 全长转录组 基因组 蜜蜂 白垩病
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2021/1/14
【目的】利用已获得的纳米孔长读段测序数据完善现有的蜜蜂球囊菌Ascosphaera apis参考基因组注释信息，并对未注释的新基因和新转录本进行鉴定和功能注释。【方法】基于已获得的纳米孔长读段测序数据，采用gffcompare软件将蜜蜂球囊菌全长转录本与参考基因组注释的转录本进行比较，进而对参考基因组注释基因的非翻译区(untranslated region, UTR)进行延长。利用TransDe...
选取海南大学油梨种质资源圃的‘Fuerte’油梨花朵和小果进行转录组测序，获得18 010条序列，总长度为29 422 056 bp。利用MISA软件检索转录组测序数据，获得分布于4 687个序列中的6 312个SSR位点。经统计发现，SSR在所检测的序列中出现的频率为35.05%。分析SSR位点特征显示，所有类型的SSR平均长度为18.90 bp，SSR之间的平均距离为4.66 kb。‘Fuer...
一组新的小麦EST-SSR标记开发及其在遗传图谱构建中的应用
小麦 EST-SSR标记 遗传图谱 RIL
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2021/4/7
为了丰富小麦功能分子标记的数量，为小麦功能基因的定位、比较基因组学、小麦起源和进化等方面的研究奠定基础。从前期利用小麦转录组数据鉴定出的8 389个EST-SSR序列中，随机选取585对引物得分大于95的标记进行分析，以川麦42和川农16杂交后自交获得的重组自交系群体为试验材料，利用新开发出的EST-SSR标记，并结合SSR标记和SRAP标记，构建了一张遗传图谱。结果表明，585对EST-SSR引...
豌豆(Pisum sativum L.)是一种重要的食用豆类作物, 在全世界范围内广泛种植, 既可作为人类食物, 也可作为牲畜饲料。用SSR标记构建的遗传连锁图谱在豌豆和其他作物的标记辅助育种中发挥着重要的作用。尽管对豌豆遗传连锁作图的研究已有悠久历史, 但公众可获得且可转移的SSR标记以及基于遗传独特的中国豌豆种质的高密度遗传连锁图谱仍然有限。为了获得更多可转移的SSR标记和中国豌豆的高密度遗传...
鉴定出与纤维产量相关性状连锁的SSR标记有助于黄麻纤维产量的分子标记辅助育种。本研究以311份黄麻种质资源为研究材料, 通过2016—2018年表型鉴定, 结合116对SSR引物扩增出397个SSR标记, 利用SPSS软件对SSR标记与纤维产量性状进行相关性分析。结果表明, 311份黄麻种质资源9个纤维产量性状的变异系数范围为13.05%~76.78%, 表现出广泛的遗传变异。农艺性状相关分析表明...
韭菜全长转录组SSR信息分析及分子标记开发
韭菜 全长转录组 SSR 无融合生殖
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2020/6/18
利用MISA软件筛选韭菜（Allium tuberosum）全长转录组测序获得的49 876条（大于500 bp）转录本序列（89.44 Mb），共检测出13 111个SSR位点，分布在10 332条转录本中，SSR出现频率为26.29%，平均分布距离为6.82 kb。在搜索的6种SSR位点类型中，1 ~ 3个核苷酸重复类型占主要地位，占总SSR位点数的98.74%，其中单核苷酸、二核苷酸和三核苷...
以226个建兰品种为材料，应用16对SSR荧光引物进行扩增，基于等位基因最大法，按照93.36%、83.19%、71.68%、64.16%、54.42%、47.35%、32.30%、23.45%、17.26%、12.39%和8.41%等11个压缩比例逐步聚类，形成备选种质。结果表明，16对SSR荧光引物共检测到135个等位基因，平均观测等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、Nei’s基因多样...
基于表型和SSR标记筛选海岛棉优异种质资源
海岛棉 表型 SSR标记 优异种质
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2020/4/26
【目的】筛选海岛棉某一性状特别突出的优异种质资源，加快其新品种的选育进程。【方法】本研究以178份海岛棉核心种质资源为试验材料，通过调查和测定铃重、单株铃数、衣分、纤维长度、纤维比强度和马克隆值6个性状的表型数据，开展变异度和遗传多样性分析。每个性状表型值按10%最优取样策略，初步筛选海岛棉优异种质资源；同时利用120对simple sequence repeat （SSR）引物对178份海岛棉核...
菜薹品质性状与SSR标记的关联分析
菜薹 品质性状 SSR标记 关联分析
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2019/11/5
为挖掘与菜薹品质性状相关的分子标记，选用具有多态性的84个SSR标记分析了81份菜薹种质材料的遗传多样性，并采用TASSEL3.0软件中混合线性模型（MLM）对菜薹群体材料的单株质量、叶绿素含量、维生素C含量、可溶性总糖含量、可溶性蛋白含量和硝酸盐含量等6个品质性状进行关联分析。结果显示，84个SSR标记在81份菜薹种质材料中共检测出310个等位位点，引物多态信息量（PIC）在0.1878 ~ 0...